Agencija za javne nabavke BiH, kao jednu od Zakonom o javnim nabavkama utvrđenih nadležnosti, vrši i praćenje postupaka javnih nabavki (monitoring) koje provode ugovorni organi.
 
Praćenjem obavještenja o dodjeli ugovora za provođenje pregovaračkih postupaka bez objave obavještenja uočena je sve učestalija primjena ove vrste postupka, te da su razlozi za primjenu ovog postupka paušalni i često se sastoje u prepisivanju odredbi iz Zakona o javnim nabavkama bez potkrijepljenja potrebnim objektivnim dokazima.

Ukazujemo na potrebu ozbiljnijeg pristupa u planiranju i pripremi projekata posebice pri provedbi otvorenih postupaka za koje se naknadno provode pregovarački postupci za dodatne radove, kako bi se situacije korištenja i primjene ove vrste postupka, kao najnetransparentnijeg postupka svele na minimum i objektivizirale što je više moguće u skladu sa odredbama Zakona o javnim nabavkama.